平常到海產店點的海瓜子蛤，其實包括了兩種很相近的種類：小眼花簾蛤
Ruditapes variegatus (Sowerby, 1852)與菲律賓簾蛤
Ruditapes philippinarum (Adams & Reeve, 1850)。兩種的外觀與口感都非常像，因此店家不會進一步細分。不過對於我等研究水產的人而言，兩種其實有很大的差異。
先看看小眼花簾蛤與菲律賓簾蛤的團體照，大家看完應該都跟筆者的結論一樣：根本分不出來。兩者花紋變異性都很大，無法用花紋區分。這時候反而要靠殼內面的套線灣（pallial sinus）來分會比較明確。
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| 小眼花簾蛤 |
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| 菲律賓簾蛤 |
先看小眼花簾蛤，套線灣就像拋物線，越深入越尖細；菲律賓簾蛤的套線灣則像中指的輪廓，不會變細，到末端才變圓。
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| 小眼花簾蛤 |
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| 小眼花簾蛤的套線灣較尖，就像橫放的拋物線。 |
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| 菲律賓簾蛤 |
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| 菲律賓簾蛤的套線灣較鈍，就像中指的輪廓。 |
過去在馬祖盛產小眼花簾蛤，但後來受到中國傳來的九孔
疱疹樣病毒影響，幾乎滅絕。後來就藉由野放種苗來復育。然而當時的執行者沒有用心區分兩種，導致後來錯放成菲律賓簾蛤。從此之後馬祖採集到的很多海瓜子蛤就不再是過去的小眼花簾蛤了。或許對於遊客與大部分居民這個差異的意義不大，但牠們已經是截然不同的品種，對原生種與生態會有何種衝擊就很難預料了。
